Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM1B2RUZ4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM1B2RUZ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms