Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NNZ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NNZ2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NNZ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A6NNZ2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNZ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNZ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNZ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNZ2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNZ2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNZ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNZ2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNZ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A6NNZ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NNZ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NNZ2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NNZ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NNZ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NNZ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NNZ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNZ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNZ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNZ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNZ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNZ2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNZ2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNZ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNZ2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms