Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRGMA1A4Y4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRGMA1A4Y4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms