Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GTW7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GTW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms