Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF24Q9UPV7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF24Q9UPV7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms