Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms