Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APTXQ7Z2E3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms