Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms