Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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NPRL3Q12980 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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NPRL3Q12980 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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NPRL3Q12980 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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NPRL3Q12980 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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NPRL3Q12980 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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NPRL3Q12980 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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