Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPAL4Q0D2K0 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms