Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AF064858.1-201ENST00000417335 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TMEM161B-207ENST00000509387 963 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms