Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN1P49257 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms