Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MMP13P45452 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP13P45452 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP13P45452 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP13P45452 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP13P45452 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP13P45452 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MMP13P45452 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MMP13P45452 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MMP13P45452 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MMP13P45452 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MMP13P45452 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MMP13P45452 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MMP13P45452 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MMP13P45452 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MMP13P45452 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MMP13P45452 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MMP13P45452 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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