Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIG1P18858 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIG1P18858 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIG1P18858 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms