Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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USP35Q9P2H5 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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USP35Q9P2H5 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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