Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNFT2Q96EX2 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNFT2Q96EX2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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