Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIRAP54198 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIRAP54198 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIRAP54198 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIRAP54198 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIRAP54198 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms