Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms