Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRHP20396 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL049871.1-201ENST00000557475 880 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL136084.3-201ENST00000605631 439 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRHP20396 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRHP20396 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRHP20396 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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