Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNA2P20248 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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