Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CREB3O43889 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CREB3O43889 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CREB3O43889 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms