Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353611.1-201ENST00000417054 462 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590483.2-201ENST00000440148 567 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCBP1-AS1-233ENST00000442326 668 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC103770.1-201ENST00000517884 833 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSGEPL1-AS1-201ENST00000520651 508 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC244090.2-201ENST00000567614 792 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC002116.2-201ENST00000586962 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF98-205ENST00000601553 566 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC134879.3-201ENST00000614446 254 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHV3-79-201ENST00000618968 341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.174-201ENST00000619127 283 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL109806.1-201ENST00000623967 1248 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINB11-209ENST00000624518 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139035.1-202ENST00000626308 565 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZCCHC17-209ENST00000627541 1158 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRR11-209ENST00000614081 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2L5P-203ENST00000638137 2176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-4Q9BYQ2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms