Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CECR2Q9BXF3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms