Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms