Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms