Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMTNP53814 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMTNP53814 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMTNP53814 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMTNP53814 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms