Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN11AQ9UI33 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms