Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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