Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGSF9Q9P2J2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms