Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LPIN3Q9BQK8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms