Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms