Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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ATG16L1Q676U5 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ATG16L1Q676U5 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ATG16L1Q676U5 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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ATG16L1Q676U5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ATG16L1Q676U5 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ATG16L1Q676U5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ATG16L1Q676U5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATG16L1Q676U5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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