Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC10A2Q12908 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC10A2Q12908 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms