Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SREBF2Q12772 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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