Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKOR1P84550 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms