Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRMP28827 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRMP28827 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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