Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYT1P21579 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms