Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms