Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
L1RE1Q9UN81 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms