Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARFGAP3Q9NP61 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms