Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms