Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT140Q96RY7 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms