Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC33Q8N5R6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms