Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms