Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ZFHX3Q15911 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.4 ms