Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM25Q14258 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms