Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms