Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD3P84022 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms