Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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