Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms